1589年,受封肥後地區(現今熊本縣)一半領土的加藤清正,策劃於茶臼山建築新城,並立即著手興建。但爲了出兵朝鮮,工程中斷,於1607年方才完成。期間經歷了關原之戰,因有功又被賞賜肥後全域52萬餘石(石→P23大名武士),築城規模因而變更,清正修改原先計劃而改建符合50萬石領主的壯偉城堡。熊本城最大的特徵,除了大小兩種“天守閣”以外,還配置有6幢“五階櫓”(三重五樓的箭樓),並在高大的石垣之上建築“多聞櫓”(連棟式長排建築型箭樓),包圍著整個城堡。連接各“曲輪”(城塞區域)間的通道以及“虎口”(城堡小門)都極爲嚴密堅牢且又構造複雜,故而也被稱爲“史上最强的城堡”。“本丸禦殿”(主城堡府邸)或「飯田丸五階櫓」等都已經逐漸整備復原,但2016年的熊本地震,使得“天守閣”及多數建造物或者石垣等倒塌損毀,現在正在復興修建之中。